蜂蜜是有一定的消炎抗菌的效果，对于组织的创伤有治疗的作用，蜂蜜的治疗伤口的作用是令细菌在创伤部位不能生存，这种情况即使没有病菌，在它的作用下，伤口的肿胀、疼痛的程度都会有大大的减轻。
并且蜂蜜还能够消除死去的肌肉，加快伤口的愈合，它主要的用法是用10%到55%的蜜汁清洗伤口，清洗完伤口以后，可以用纯蜜涂抹创面并且包扎，有很好的消炎、促进创口愈合的作用，所以蜂蜜有消炎抗菌的效果。
新鲜成熟的蜂蜜对多种细菌具有较强的抑制或灭杀作用，如流感杆菌、肠道杆菌、链球菌、黄曲霉菌、沙门氏菌以及革兰氏阴性 和阳性等多种致病菌。在人们的生活中，以上病菌无所不在，时常寻机侵害人体，利用蜂蜜即可以对付它们。例如肠道杆菌，总是寻找时机在肠道中作祟，造成肠道不适、疼痛或拉稀，而经常服用蜂 蜜，即可以控制细菌的活动，从而避免或减轻了病变和症状，保证 了肠道的正常功能和有效运作。
蜂蜜的抑菌机理主要有以下几方面：
(1) 蜂蜜含有大量碳水化合物，高渗透压会导致细菌细胞脱水死亡。
(2) 蜂蜜中的葡萄糖氧化酶和过氧化氢均具有抑菌活性。
(3) 来自蜜源植物中的黄酮类、酚类化合物、挥发性物质 和香豆素类物质具有较强抑菌作用。
蜂蜜的抗菌消炎作用，与其浓度有着直接关系，低浓度蜂蜜有抑菌作用，高浓度蜂蜜可杀灭细菌，高浓度蜂蜜算得上是天然的抗菌防腐剂，从而显现出高浓度的优势。鉴于蜂蜜的髙功效抗菌消炎及防病作用，在临床上人们将之用于结肠炎、肺结核、咳嗽等疾病的治疗，临床证明，蜂蜜对于上呼吸道感染导致的咳嗽有很好的缓解和治疗作用。在外科上被用作创伤消炎止痛等，还被用来养护和保存心脏、肾脏等移植器官。研究与实践证明，用蜂蜜保养移植器官的作用远比其他营养液好
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